核酸かくさん序列じょれつ

核酸かくさん序列じょれつ（英語えいご：Nucleic acid sequence）是ぜ指ゆび核酸かくさん結構けっこう中なか的てき含氮鹼基，共有きょうゆう四よん種しゅ，分別ふんべつ為ためA（腺せん嘌呤）、T（胸腺きょうせん嘧啶）、C（胞嘧啶）、G（鳥とり糞くそ嘌呤），並なみ且有無窮むきゅう盡つき的てき線せん性せい排列はいれつ組合くみあい來らい表ひょう達たち基もと因いん，而各個かっこ基もと因いん都と具有ぐゆう獨特どくとく的てき鹼基序列じょれつ^[1]^{[查证请求]}。两个碱基形成けいせい一个碱基对，碱基对的配はい对规律りつ是ぜ固定こてい的てき，即そくA配はい對たいT，C配はい對たいG。三个相邻的碱基对形成一个密みつ码子。一种密码子对应一种氨基酸，不同ふどう的てき氨基酸さん合成ごうせい不同ふどう的てき蛋白たんぱく质。在ざいDNA的てき复制及蛋白しろ质的合成ごうせい过程中ちゅう，碱基配はい对规律りつ是ぜ十じゅう分ふん关键的てき。

DNA的てき字母じぼ排列はいれつ有ゆうA、C、G、T，(RNA則のり為ためA、U、C、G，詳しょう見みRNA)。鹼基對たい會かい无间隔的てき排列はいれつ在ざい一いち起おこり，例れい如序列じょれつAAAGTCTGAC。任意にんい长度大だい于4的てき一串核苷酸被称作一个序列。关于它的生物せいぶつ功こう能のう，则依赖于上下じょうげ文ぶん的てき序列じょれつ，一个序列可能被正读，反はん读；包含ほうがん编码或ある者もの无编码。DNA序列じょれつ也可能かのう包含ほうがん非ひ編へん碼DNA。

核酸かくさん也具有ぐゆう二に级结构和わ三さん级结构。一级结构有时被错误地称为一级序列。相反あいはん，没ぼつ有ゆう并行的てき二级或三级序列概念。

核かく苷酸

核酸かくさん由よし称しょう为核かく苷酸的てき连接单位的てき长链组成。每まい个核かく苷酸由よし三个亚基组成：磷酸基もと团和糖とう（在ざいRNA的てき情じょう况下是ぜ核かく糖とう，而在DNA中なか的てき脱だつ氧核糖とう）构成核酸かくさん链的骨こつ架か，并且与糖とう连接是ぜ一いち组核かく碱基之これ一いち。核かく碱基在ざい链的碱基对中ちゅう是ぜ重要じゅうよう的てき，以形成けいせい更さら高だか级的二に级结构和わ三さん级结构，例れい如着名めい的てき双そう螺旋らせん。

可能かのう的てき字母じぼ是ぜA，C，G和わT，代表だいひょうDNA链的四よん个核かく苷酸碱基 - 腺せん嘌呤，胞嘧啶，鸟嘌呤，胸腺きょうせん嘧啶 - 与あずか磷酸二に酯骨ほね架か共きょう价连接。在ざい典型てんけい情じょう况下，序列じょれつ无间隙すき地ち相互そうご邻接被ひ印刷いんさつ，如AAAGTCTGAC序列じょれつ中ちゅう从5'到いた3'方向ほうこう从左到いた右みぎ读。关于转录，如果序列じょれつ与あずか转录的てきRNA具有ぐゆう相しょう同どう的てき顺序，则序列じょれつ位い于编码链上じょう。

一个序列可以与另一个序列互补性せい(分子生物学ぶんしせいぶつがく)（英えい语：Complementarity (molecular biology)），这意味いみ着ぎ它们在ざい互补的てき每まい个位置いち上じょう具有ぐゆう碱基（即そくA至いたりT，C至いたりG）并且以相反あいはん的てき顺序。例れい如，TTAC的てき互补序列じょれつ是ぜGTAA。如果双そう链DNA的てき一条链被认为是有义链（sense strand），那な么被认为是ぜ反はん义链的てき另一条链将具有与有义链的互补序列。

符号ふごう

比ひ较和确定两个核かく苷酸序列じょれつ之の间的％差さ异。

AATCCGCTAG
AAACCCTTAG
给定两个10个核苷酸的てき序列じょれつ，将はた它们排はい成なり一行并比较它们之间的差异。通つう过将不同ふどうDNA碱基的てき数量すうりょう除じょ以核苷酸的てき总数来らい计算相似そうじ性せい百ひゃく分ふん比ひ。在ざい上述じょうじゅつ情じょう况下，10个核苷酸序列じょれつ存在そんざい三さん个差异。因よし此，将はた7/10除じょ以得到いた70％的てき相似そうじ度ど，并从100％减去得え到いた30％的てき差さ异。

虽然A，T，C和わG代表だいひょう某ぼう个位置いち的てき特定とくてい核かく苷酸，但ただし也有やゆう代表だいひょう模糊もこ性せい的てき字母じぼ，当とう在ざい该位置いち可能かのう出で现一种以上的核苷酸时使用这些字母。国くに际纯粹いき与あずか应用化学かがく联合会かい（IUPAC）的てき规则如下^[2]：

符号ふごう^[3]	描述	被ひ表ひょう现碱基もと					互补碱基
A	腺せん嘌呤	A				1	T
C	胞嘧啶		C				G
G	鸟嘌呤			G			C
T	胸腺きょうせん嘧啶				T		A
U	尿にょう嘧啶				U		A
W	Weak	A			T	2	W
S	Strong		C	G			S
M	胺	A	C				K
K	酮			G	T		M
R	嘌呤	A		G			Y
Y	嘧啶		C		T		R
B	除じょA外そと (B comes after A)		C	G	T	3	V
D	除じょC外そと (D comes after C)	A		G	T		H
H	除じょG外そと (H comes after G)	A	C		T		D
V	除じょT外そと (V comes after T and U)	A	C	G			B
N	任にん何なに Nucleotide (not a gap)	A	C	G	T	4	N
Z	0					0	Z

这些符号ふごう对RNA也有やゆう效こう，除じょ了りょう用ようU（尿にょう嘧啶）代替だいたいT（胸腺きょうせん嘧啶）^[2]。

除じょ了りょう腺せん嘌呤（A），胞嘧啶（C），鸟嘌呤（G），胸腺きょうせん嘧啶（T）和かず尿にょう嘧啶（U）之これ外がい，DNA和わRNA还含有がんゆう在ざい核酸かくさん链形成けいせい后きさき已やめ被ひ修おさむ饰的碱基。在ざいDNA中ちゅう，最さい常つね见的修おさむ饰碱是ぜ5-甲きのえ基はじめ胞苷（m5C）。在ざいRNA中ちゅう，有ゆう许多修おさむ饰的碱基，包括ほうかつ假かり尿にょう苷（Ψぷさい），二に氢尿苷（D），肌はだ苷（I），核かく糖とう胸むね苷（rT）和わ7-甲きのえ基はじめ鸟苷（m7G）^[4]^[5]。次じ黄き嘌呤和わ黄き嘌呤是ぜ通どおり过诱变剂存在そんざい产生的てき许多碱中的てき两种，它们都通みやこどおり过脱氨作用よう（用よう羰基取と代だい胺基）。次じ黄き嘌呤是ぜ由ゆかり腺せん嘌呤产生的てき，而黄き嘌呤是ぜ由ゆかり鸟嘌呤产生的てき^[6] 。类似地ち，胞嘧啶的てき脱だつ氨基作用さよう导致尿にょう嘧啶。

生物せいぶつ学がく意い义

遗传密みつ码的てき一いち个描述じゅつ，通つう过该遗传密みつ码将はた核酸かくさん中ちゅう包含ほうがん的てき信しん息いき翻こぼし译成なり蛋白たんぱく质中なか的てき氨基酸さん序列じょれつ。

在ざい生物せいぶつ系けい统中，核酸かくさん含有がんゆう活かつ细胞用よう于构建けん特定とくてい蛋白たんぱく质的てき信しん息いき。核酸かくさん链上的てき核かく碱基序列じょれつ通どおり过细胞机器き翻こぼし译成构成蛋白たんぱく质链的てき氨基酸さん序列じょれつ。被ひ称しょう为一个密みつ码子(codon)的まと每ごと组三さん个碱基对应于单个氨基酸さん，并且存在そんざい特定とくてい的てき遗传密みつ码，通つう过该遗传密みつ码，三个碱基的每种可能组合对应于特定氨基酸さん。

分子生物学ぶんしせいぶつがく的てき中心ちゅうしん法ほう则概がい述じゅつ了りょう使用しよう核酸かくさん中ちゅう包含ほうがん的てき信しん息いき构建蛋白たんぱく质的机つくえ制せい。 DNA被ひ转录成なりmRNA分子ぶんし，其进入いれ核かく糖とう体からだ，其中mRNA用作ようさく构建蛋白たんぱく质链的てき模も板ばん。由よし于核酸かくさん可か以与具有ぐゆう互补序列じょれつ的てき分子ぶんし结合，因いん此在编码蛋白たんぱく质的“有ゆう义”序列じょれつ和本わほん身み无功能のう但ただし可か以与有ゆう义链结合的てき互补“反はん义”序列じょれつ之の间存在そんざい区く别。

参まいり见

参考さんこう文献ぶんけん

^ Neil A.Campbell. Biology： A Global Approach, Global Edition. U.S.: Pearson. 2018. ISBN 978-1292170435.
^ ^2.0 ^2.1 Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences （页面存そん档备份，存そん于互联网档案あん馆）, NC-IUB, 1984.
^ Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry (NC-IUB). Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences. 1984 [2008-02-04]. （原始げんし内容ないよう存そん档于2017-08-21）.
^ BIOL2060: Translation. mun.ca. [2018-12-26]. （原始げんし内容ないよう存そん档于2020-08-05）.
^ Research. uw.edu.pl. [2018-12-26]. （原始げんし内容ないよう存そん档于2017-09-12）.
^ Nguyen, T; Brunson, D; Crespi, C L; Penman, B W; Wishnok, J S; Tannenbaum, S R. DNA damage and mutation in human cells exposed to nitric oxide in vitro. Proc Natl Acad Sci U S A. April 1992, 89 (7): 3030–3034. PMC 48797 . PMID 1557408. doi:10.1073/pnas.89.7.3030.

[1] Neil A.Campbell. Biology： A Global Approach, Global Edition. U.S.: Pearson. 2018. ISBN 978-1292170435.

[NCIUB-2] 2.0 ^2.1 Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences （页面存そん档备份，存そん于互联网档案あん馆）, NC-IUB, 1984.

[iupac-3] Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry (NC-IUB). Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences. 1984 [2008-02-04]. （原始げんし内容ないよう存そん档于2017-08-21）.

[4] BIOL2060: Translation. mun.ca. [2018-12-26]. （原始げんし内容ないよう存そん档于2020-08-05）.

[5] Research. uw.edu.pl. [2018-12-26]. （原始げんし内容ないよう存そん档于2017-09-12）.

[6] Nguyen, T; Brunson, D; Crespi, C L; Penman, B W; Wishnok, J S; Tannenbaum, S R. DNA damage and mutation in human cells exposed to nitric oxide in vitro. Proc Natl Acad Sci U S A. April 1992, 89 (7): 3030–3034. PMC 48797 . PMID 1557408. doi:10.1073/pnas.89.7.3030.

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