Το διφθοριούχο γερμάνιο σχηματίζει ορθορομβικούς κρυστάλλους μεμια ομάδα διαστήματος P212121 (No. 19), μεσύμβολο Pearson oP12, καισταθερές κρυσταλλικού πλέγματος a = 0.4682 nm, b = 0.5178 nm, c = 0.8312 nm, Z = 4 [τέσσερεις (4) δομικές μονάδες ανά κελί]. Η κρυσταλλική του δομή χαρακτηρίζεται από ισχυρές πολυμερικές αλυσσίδες που αποτελούνται από πυραμίδες [GeF3]. Ένα από τα άτομα φθορίου στην πυραμίδα μοιράζεται σεδυο γειτονκές αλυσίδες, παρέχοντας έναν ασθενή σύνδεσμο μεταξύ τους[1]. Μια άλλη, λιγότερο συνηθισμένη κρυσταλλική δομή διφθοριούχου γερμάνιου έχει τετραγωνικήσυμμετρίαμεμια ομάδα διαστήμαος P41212 (No. 92), σύμβολο Pearson tP12, και σταθερές κρυσταλλικού μοτίβου a = 0.487 nm, b = 0.6963 nm, c = 0.858 nm[2].
↑Trotter, James; Akhtar, M.; Bartlett, Neil (1966). "The crystal structure of germanium difluoride". Journal of the Chemical Society A: Inorganic, Physical, Theoretical: 30. doi:10.1039/J19660000030.
↑G.P. Adams, L.M. Albritton, D.W. Bonnell, J.L. Margrave, J. Scott, P.W. Wilson (1971). "A new solid phase in germanium difluoride". Journal of the Less Common Metals 24 (1): 113–116. doi:10.1016/0022-5088(71)90174-3.