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シュードモナス科か

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シュードモナス科か
UVライト下かで蛍光けいこうを呈ていするシュードモナス・フルオレッセンス（Pseudomonas fluorescens）
分類ぶんるい
ドメイン : 真正しんしょう細菌さいきん
Bacteria
門もん : Pseudomonadota門もん
綱つな : ガンマプロテオバクテリア綱つな
Gammaproteobacteria
目め : シュードモナス目め
Pseudomonadales
科か : シュードモナス科か
Pseudomonadaceae
学名がくめい
Pseudomonadaceae
Winslow et al. 1917[1]
(IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[2]
タイプ属ぞく
シュードモナス属ぞく
Pseudomonas
Migula 1894[3]
(IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[2]
修正しゅうせい　Yang et al. 2013[4]
(IJSEMリストに掲載けいさい 2014)[5]
シノニム
  • アゾトバクター科か
    Azotobacteraceae
    Pribram 1933[6]
    (IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[2]
下位かい分類ぶんるい（属ぞく）

本文ほんぶんを参照さんしょう

シュードモナス科か（ーか、Pseudomonadaceae）とは真性しんせい細菌さいきんの科かの一ひとつである。

歴史れきし

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シュードモナス菌きん（Pseudomonad）はギリシャ語ごのpseudo (ψぷさいεいぷしろんυうぷしろんδでるたοおみくろん - 偽にせの)とmonos (μονος - 一団いちだん)との成語せいごであり、直訳ちょくやくで「偽にせの一団いちだん」の意味いみである。"monad"は微生物びせいぶつ学がくの初期しょきから用もちいられてきた用語ようごであり、単細胞たんさいぼう生物せいぶつを指さす。シュードモナス菌きんは普遍ふへん的てきに存在そんざいする微生物びせいぶつであるため、微生物びせいぶつ学がくの初期しょきからその存在そんざいを認識にんしきされており、研究けんきゅうされてきた。シュードモナス属ぞく（Pseudomonas）という語かたりは1894年ねんに登場とうじょうした。当時とうじは、グラム陰性いんせいで桿状かつ胞子ほうし生産せいさん性せいの細菌さいきんという非常ひじょうに漠然ばくぜんとした定義ていぎであった。シュードモナス菌きんは膨大ぼうだいな種類しゅるいのニッチから単たん離はなされ、非常ひじょうに多おおくの種たねがシュードモナス属ぞくに分類ぶんるいされることになった。種たねの振ふり分わけが見直みなおされ、新あらたに制定せいていされた分類ぶんるい法ほうと、生体せいたい高分子こうぶんし（核酸かくさんやタンパク質たんぱくしつ）に基もとづく手法しゅほうにより多おおくの種たねは再さい分類ぶんるいされた。

アゾトバクター科か（Azotobacteriaceae）は2004年ねんにこの科かに統合とうごうされた[7]。

2000年ねんにシュードモナス属ぞく（Pseudomonas）の複数ふくすうの種たねについて完全かんぜんゲノムのシークエンシングが行おこなわれた。以降いこう、P. aeruginosa PAO1 (2000)やP. putida KT2440 (2002)、P. fluorescens Pf-5 (2005)、P. fluorescens PfO-1、P. entomophila L48についても完全かんぜんゲノムの解読かいどくがなされた。Pseudomonas syringaeの植物しょくぶつ病びょう原種げんしゅ ― pathovar tomato DC3000 (2003)やpathovar syringae B728a (2005)、pathovar phaseolica 1448A (2005) ― のDNAシークエンシングも行おこなわれた。

特性とくせい

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オキシダーゼ活性かっせいと胞子ほうし産さん生せい性せい、発酵はっこう不ふ活性かっせいである点てんが、同おなじガンマプロテオバクテリア綱つなの腸ちょう内ない細菌さいきん科かと異ことなる[9]。

下位かい分類ぶんるい（属ぞく）

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IJSEMに正式せいしき承認しょうにんされた属ぞく

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以下いかにシュードモナス科かに属ぞくする属ぞくを列挙れっきょする(2024年ねん6月がつ現在げんざい)[10]。

Rudra and Gupta 2021[11] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[12]
Winogradsky 1938[13] (IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[2]、修正しゅうせい Rudra and Gupta 2024[14]
Thompson and Skerman 1981[15] (IJSEMリストに掲載けいさい 1981)[16]
Beijerinck 1901[17] (IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[2]、修正しゅうせい Rudra and Gupta 2024[14]
Holmes et al. 1986[18]、修正しゅうせい　Holmes et al. 1987[19]、修正しゅうせい Rudra and Gupta 2024[14]
Saati-Santamaría et al. 2021[20] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[21]
Wang et al. 2020[22]
Rudra and Gupta 2021[11] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[12]
Nishimura et al. 1989[23]
Wang et al. 2014[24] (IJSEMリストに掲載けいさい 2015)[25]
Migula 1894[3] (IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[2]、修正しゅうせい　Yang et al. 2013[4] (IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[5]
後藤ごとう正夫まさおと桑田くわた博隆ひろたか 1988[26]、修正しゅうせい　Stackebrandt et al. 2009[27] (IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[28]、修正しゅうせい　Imai et al. 2013[29] (IJSEMリストに掲載けいさい 1980)[30]
Austin and Moss 1987[31] (IJSEMリストに掲載けいさい 1986)[32]、修正しゅうせい　Jeon et al. 2021[33] (IJSEMリストに掲載けいさい 2022)[34]
Tan et al. 2015[35] (IJSEMリストに掲載けいさい 2015)[36]、修正しゅうせい　Rudra and Gupta 2021[11] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[12]

IJSEMに未み承認しょうにんの属ぞく

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  • "Alginomonas"　アルギノモナス属ぞく
Thjotta and Kass 1945[37]
  • "Alginovibrio"　アルギノビブリオ属ぞく
Thjotta and Kass 1945[37]
  • "Azotomonas"　アゾトモナス属ぞく
Orla-Jensen 1909[38]
  • "Protaminobacter"　プロタミノバクター属ぞく
Den Dooren-De Jong 1926[39]
  • "Saccharomonas"　サッカロモナス属ぞく
Shimwell 1950[40]
  • "Sporovibrio"　スポロビブリオ属ぞく
Starkey 1938[41]
  • Azomonotrichon　アゾモノトリコン属ぞく
Thompson and Skerman 1981[42] (IJSEMリストに掲載けいさい 1981)[16]
Azomonas アゾモナス属ぞくのシノニム[43]
  • Flavimonas　フラビモナス属ぞく
Holmes et al. 1987[19]
Pseudomonas シュードモナス属ぞくのシノニム[44]
  • Neopseudomonas　ネオシュードモナス属ぞく
Saati-Santamaría et al. 2021[20] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[21]
Halopseudomonas ハロシュードモナス属ぞくのシノニム[11]
  • Oblitimonas　オブリチモナス属ぞく
Drobish et al. 2016[45] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[46]
Thiopseudomonas チオシュードモナス属ぞくのシノニム[11]
  • Parapseudomonas　パラシュードモナス属ぞく
Saati-Santamaría et al. 2021[20] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[21]
Atopomonasのシノニム[11]
  • Serpens　サーペンス属ぞく
Hespell 1977[47] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[2]
Pseudomonas シュードモナス属ぞくのシノニム[48]
  • Stutzerimonas　
Lalucat et al. 2022[49] (IJSEMリストに掲載けいさい 2021)[50]、修正しゅうせい Rudra and Gupta 2024[14]
Pseudomonas シュードモナス属ぞくのシノニム

脚注きゃくちゅう

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[脚注きゃくちゅうの使つかい方かた]
  1. ^ C.-E. A. Winslow, Jean Broadhurst, R. E. Buchanan, Charles Krumwiede, Jr., L. A. Rogers, George H. (1 September 1917). “The Families and Genera of the Bacteria: Preliminary Report of the Committee of the Society of American Bacteriologists on Characterization and Classification of Bacterial Types”. Journal of Bacteriology 2 (5): 505-66. PMC 378727. PMID 16558764. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC378727/. 
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