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しょう分子ぶんしかくとう核酸かくさん

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重定しげさだこうほろRNA
しょう分子ぶんしかくとう核酸かくさん(miRNA)あずかmRNA作用さようてき
miRNAくき环的实例,成熟せいじゅくmiRNA显示为红しょく
甘藍かんらんpre-microRNAちゅうてきくきたまき(stem-loop)きゅう結構けっこう

しょう分子ぶんしかくとう核酸かくさん英語えいごmicroRNA缩写miRNA),またたたえほろRNA[1]ほろかくとう核酸かくさん),かく生物せいぶつ中廣なかひろ存在そんざいてきいちしゅちょうやく21いた23かく苷酸てきRNA分子ぶんし調節ちょうせつ其他もといんてきおもて[2][3]。miRNAいち些從DNAてんろく而來,ただし無法むほうしんいちてんやくなり蛋白質たんぱくしつてきRNA(ぞくへん碼RNA)。miRNA通過つうかあずか目標もくひょうmRNA结合,しん抑制よくせい转录こうてきもといんひょう[4]ざい调控もといんひょう达、细胞周期しゅうき生物せいぶつたい发育时序とう方面ほうめんおこり重要じゅうよう作用さようざい动物ちゅういち个miRNA通常つうじょう以调ひかえすうじゅうもといん

這些RNAしたがえ初級しょきゅうてんろくほん(primary transcript)出來できてき,也就pri-miRNA,てん變成へんせいためしょうためpre-miRNAてきくきたまき結構けっこう最後さいごなりため具有ぐゆうこうのうてき成熟せいじゅくmiRNA。

1989ねん维克たく·やすぬの罗斯发现しゅう丽隐杆线ちゅう(C. elegans)中有ちゅううもといんlin-4抑制よくせい另一个基いん lin-14。们认为lin-4应该也表达一种调ひかえ蛋白たんぱくいん为基いん转录なりRNA并翻译成蛋白たんぱく质是とう时认为的公理こうり1993ねん,维克たくてき学生がくせい Rosalind Lee Phonda Feinbaum かつりゅういずるりょうlin-4,却发现这个基いん非常ひじょうしょう不足ふそく以做蛋白質たんぱくしつ,而且这个もといんてき产物確實かくじつ也不蛋白たんぱく质,而是一个长度只有22个核苷酸てきRNA,後來こうらいじん們又發現はつげん此miRNA以和其他蛋白質たんぱくしつ結合けつごう,阻斷其他表現ひょうげん最終さいしゅうさんせい上述じょうじゅつてきもといん抑制よくせい現象げんしょう。它是よし单链てきRNA分子ぶんし产生,这个分子ぶんしてき一端折回来形成不完全的互补配对,しょうくきたまき[5]

pri-miRNA长度だい约为300~1000个碱もと,pri-miRNA经过いち加工かこうきさきなり为pre-miRNAそくmicroRNAぜんからだ,长度だい约为70~90个碱基;pre-miRNAさい经过Dicer酶酶きりきさきなり为长约20~24ntてき成熟せいじゅくmiRNA。实际研究けんきゅうちゅう,pre-miRNA应用最早もはや,也最广泛。近年きんねん研究けんきゅう发现microRNAてきそうひじ成熟せいじゅくmiRNAてき形成けいせいゆうじゅうふん重要じゅうようてき作用さよう

あずかしょう分子ぶんしsiRNAsしょう,miRNAざい分子ぶんし特性とくせいとう方面ほうめん相似そうじてきただし存在そんざいしょうまと异。siRNAそうまたRNA,3'はしゆう2个非はい对碱もと通常つうじょう为UU;miRNA单股RNA。siRNAsゆかりdsRNAざいDicer酶切割下わりした产生,而成熟せいじゅくmiRNAsてき产生よう复杂いち些,しゅさきpri-miRNAざいかくないよしいち种称为Drosha酶处きさきなり为大约70ntてき带有くき环结构的Precursor miRNAs(pre-miRNAs),这些pre-miRNAsさいざいExportin-5帮助转运到细胞かく外之そとゆききさきさいよし胞质Dicer酶进ぎょう处理,酶切きさきなり成熟せいじゅくてきmiRNAs。

生命せいめいてき一些重要活动如幼虫的生长发育、细胞てき发生分化ぶんかかみ经系统てき分化ぶんかとう一些非编码蛋白的小RNAてき调控,而除miRNA、siRNA以外いがいてきしょうRNAわが们目ぜん知之ともゆき甚少。

2024ねん10がつ7にち,miRNA及其转录きさきおさむつくえせい发现しゃ维克たく·やすぬの罗斯加里かり·鲁夫こん获得诺贝尔生理学せいりがくある医学いがく[6][7]

命名めいめい规则

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miR-ぜん缀后めんしょ跟着てき数字すうじ代表だいひょう命名めいめいてき顺序,如,miR-124miR-456发现とくはや

“miR-”代表だいひょう成熟せいじゅくてきmiRNA、“mir-”代表だいひょうpre-miRNApri-miRNA、“MIR”代表だいひょう编码miRNAてきもといん[8]

miRNA几乎ぜんどくいちてき编码顺序,ただし对于拥有一两个碱基不同的则会被标上字母以示,れい如,miR-124aあずかmiR-124b。 わか成熟せいじゅくてきmiRNAしょうどうただしpre-miRNApri-miRNA编码们的もといんらい不同ふどうてきもといん组,则使用しよう数字すうじらい表示ひょうじれい如,mir-194-1mir-194-2表示ひょうじ两个pre-, pri-miRNA剪切きさきてき成熟せいじゅくmiRNA完全かんぜんしょうどうてきただし却是两个不同ふどうてきらいげん

ぜん缀的三个字母代表了不同的种族来源,れい如,hsa-miR-194代表だいひょうmiRNAらいみなもと于人类,oar-miR-124らいみなもと于绵ひつじ

对于形成けいせいpre-,pri-miRNAくきたまきてき两端miRNA, 通常つうじょう一端在数量上远远超过另一端。数量すうりょう优势てき一端往往称为guide strand,而另一端被称为passenger strand,通常つうじょう大量たいりょうくだかいよう*ごうらい表示ひょうじれい如miR-124miR-124*。

生物せいぶつ合成ごうせいせい

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ゆうたち40%てきmiRNA於其もといんてき內含ある甚至そと顯子あきこなか[9]通常つうじょうただしきり於)ざいゆうよし方向ほうこう發現はつげん[10][11]いん此它們通常つうじょうあずか宿主しゅくしゅもといんいちおこり調節ちょうせつ[9][12][13]於DNAばんじょうてき序列じょれつなみ成熟せいじゅくmiRNAてき最終さいしゅうへん碼:ゆう6%てき人類じんるいmiRNAゆうRNA編輯へんしゅうてき現象げんしょう,RNAじょう特定とくてい位置いちてき修飾しゅうしょくかいさんせい們DNA不同ふどうてき產物さんぶつ。這增加ぞうかりょうmiRNA作用さようてき多樣たようせい範圍はんいとお超過ちょうかりょうもといんぐみ單獨たんどく引起てき作用さよう

てんろく

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miRNAもといん通常つうじょうゆかりRNA聚合酶Ⅱてんろく[14][15],聚合酶常常會じょうかい結合けつごういたDNA序列じょれつ附近ふきんてきけいどうなみはた其編碼成ぜんmiRNAてきかみ夾環。 所得しょとくいたてきてんろく產物さんぶつうえゆう5'はしぼう聚腺苷酸なみやめかむ剪接動物どうぶつてきmiRNA最初さいしょてんろくためやく80かく苷酸てきRNAくきたまき,其會交互こうご形成けいせいいくひゃくかく苷酸ちょうてきmiRNAぜんからだしょうさくpri-miRNA[14][10]とうざい3'UTR(3'へん碼區)ちゅう發現はつげんくき-たまきぜんからだ,該轉ろくぶつ作為さくいpri-miRNAmRNA[10]。 此外,RNA聚合酶Ⅲ也會てんろくいち些miRNA,特別とくべつ具有ぐゆうじょうゆうAluもとけんてきtRNAある哺乳ほにゅう動物どうぶつひろし分散ぶんさん重複じゅうふく(mammalian-wide interspersed repeats)けいどう單元たんげん[16]

かく加工かこう

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人類じんるいDrosha蛋白たんぱくてきXせんあきらたい結構けっこうあずか兩個りゃんこDGCR8分子ぶんし綠色みどりいろてきCはし螺旋らせんふく合體がったい。Drosha包含ほうがん兩個りゃんこかくとう核酸かくさん酶III結構けっこう區域くいき藍色あいいろ橙色だいだいいろ),そう鏈RNA結合けつごう結構けっこう區域くいき(黃色おうしょく),以及含有がんゆう結合けつごう兩個りゃんこ鋅離てき平台ひらだい結構けっこういき灰色はいいろ)。らいみなもとPDB 5B16.

たんpri-miRNA含有がんゆう1いたり6miRNA precursor,這些かみ夾環結構けっこうかく自由じゆうやく70かく苷酸組成そせい,而每かみ夾的がわつばさ包含ほうがんりょうRNA加工かこうてき必要ひつよう序列じょれつざいpri-miRNAちゅうかみ夾的そう鏈RNA(dsRNA)結構けっこうかいしょうためDiGeorge綜合そうごうしょうせきかぎ8(DGCR8ある脊椎動物せきついどうぶつちゅうてき“Pasha”)てきかく蛋白たんぱくしょ識別しきべつずいDGCR8あずかDrosha酵素こうそ結合けつごう形成けいせいほろ加工かこうふく合體がったい(Microprocessor complex)[17][18]

ざい該複ごうぶつちゅう,DGCR8使つかいDroshaてきRNase III催化結構けっこう區域くいきていむかい,藉此したがえかみ夾鹼もと中切なかぎりわりやく11個いっこかく苷酸,したがえ釋放しゃくほうpri-miRNAてきかみ夾彎[19][20]所得しょとく產物さんぶつざい其3'はし具有ぐゆう兩個りゃんこかく苷酸てき突出とっしゅつはし,其也具有ぐゆう3'羥基5'磷酸もとだん。它通常つうじょうしょうためぜんmiRNA(pre-miRNA)。ゆう許多きょたたい有效ゆうこう加工かこう重要じゅうようてきpre-miRNAゆうてき序列じょれつもとじょ(Sequence motif),やめ識別しきべつ鑑定かんていりょう[21][22][23]

而對於那些繞ほろ加工かこうふく合體がったい直接ちょくせつ剪接內含てきぜんmiRNA,しょうため“Mirtrons”。其最初さいしょみとめためただ存在そんざい於果はえ秀麗しゅうれいかくれ桿線ちゅうちゅうしか現在げんざいやめけいざい哺乳ほにゅう動物どうぶつちゅう發現はつげん存在そんざい[24]ゆうたち16%てきpre-miRNA透過とうかかくRNA編輯へんしゅう改變かいへん[25][26][27],其中さいつね見地けんち,如せん苷脫氨酶作用さよう於RNA(ADAR)じょうてきせんいたりはだ(AいたりI)轉換てんかん。另外,RNA編輯へんしゅう也能停止ていしかく加工かこう(れい如pri-miR-142,其會しるべ致核とう核酸かくさん酶Tudor-SNてきくだかい),なみ改變かいへんゆうりゅうほど包括ほうかつ細胞さいぼうしつmiRNAてき加工かこうあずか目標もくひょうせんいちせい(ぞう改變かいへん中樞ちゅうすう神經しんけい系統けいとうちゅうmiR-376てき種子しゅし區域くいき)[25]

かく輸出ゆしゅつ

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人類じんるいexportin-5蛋白たんぱく紅色こうしょくあずかRan-GTP(黃色おうしょくふくごうぶつpre-miRNA(綠色みどりいろ)及雙かく苷酸突出とっしゅつはし識別しきべつもとけん橙色だいだいいろ)。らいみなもとPDB 3A6P.

かくほそ胞穿梭蛋しろExportin-5わたる及前miRNAかみ夾從細胞さいぼうかく輸出ゆしゅつてき過程かてい。這種蛋白質たんぱくしつkaryopherin家族かぞくてきいち成員せいいん,它會識別しきべつぜんmiRNAかみ夾的3'末端まったんゆかりRNase III酶與Drosha遺留いりゅうてき兩個りゃんこかく苷酸てき突出とっしゅつはし。 Exportin-5-mediatedかいしるべうん輸到細胞さいぼうしつ是能これよしりょう依賴いらいてき(主動しゅどう運輸うんゆ),其使用しようGTPらい綁定Ran蛋白たんぱく[28]

細胞さいぼうしつ加工かこう

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ざい細胞さいぼうしつちゅうぜんmiRNAかみ夾會よしRNaseIII酶Dicerしょきりわり[29] ,該內きりかくとう核酸かくさん酶與miRNAかみ夾的5'3'はし相互そうご作用さようなみ切除せつじょ連接れんせつ3'5'ひじてきたまき[30]さん生長せいちょうため22かく苷酸てき不完全ふかんぜんてきmiRNA:miRNA*そう鏈體[29]せいかみ夾長かずたまき尺寸しゃくすん都會とかい影響えいきょうDicerてき加工かこう效率こうりつよし於RNAてき不完全ふかんぜんはいたい性質せいしつ,miRNA:miRNA*そう鏈體てきはいたい程度ていど也會影響えいきょうきりわり[29][31]

此外,いち些富含Gてきpre-miRNA以潛在地ざいち利用りようG-よんれんたいらいがえだい典型てんけいてきくき-たまき結構けっこうれい如,人的じんてきpre-miRNA 92B就使用しようG-よんれんたいらい抵抗ていこうDicerざい細胞さいぼうしつちゅうてきかいしるべきりわり[32] 雖然そう鏈體てきにんいち鏈,みな作為さくい潛在せんざい作用さようてきこうのうmiRNA,ただし通常つうじょうただゆういちじょう鏈會摻入RNA誘導ゆうどう沉默ふく合體がったい(RISC)ちゅうざい其中該miRNAかいあずか目標もくひょうmRNA相互そうご作用さよう


植物しょくぶつちゅうてき生物せいぶつ合成ごうせい

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ざい植物しょくぶつちゅうmiRNAてき生物せいぶつ合成ごうせいあずか動物どうぶつてき最大さいだい差異さい主要しゅようざい於核加工かこう輸出ゆしゅつてき過程かていちゅう:其不ぞう動物どうぶつ使用しようりょうたね不同ふどうてききりわり酶(一種位於核內部、一種いっしゅ於核外部がいぶ)。植物しょくぶつてきりょうたねきりわりみやこただし利用りようしょうためDicer-like1(DL1)(Dicerどうみなもとぶつ)進行しんこうゆかり於DL1僅在植物しょくぶつてき細胞さいぼうかく中表なかおもてたち,這表明ひょうめい這兩しゅきりわりざいかく發生はっせいざい植物しょくぶつmiRNA:miRNA *そう鏈體てんうん細胞さいぼうかくまえ,其3'突出とっしゅつはしかいしょうためHua-Enhancer1(HEN1)てきRNAきのえはじめ轉移てんい蛋白たんぱくきのえはじめしかこう透過とうかしょうためHast(HST)てき蛋白質たんぱくしつ(Exportin 5蛋白たんぱくてきどうみなもとぶつはたそう鏈體したがえ細胞さいぼうかくうんいた細胞さいぼうしつちゅうざいうら它們かい分解ぶんかいなみ生成せいせい成熟せいじゅくてきmiRNA,らい結合けつごういたRISCちゅう[33]

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外部がいぶ連結れんけつ

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まいり

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