转录因子 いんし 激 げき 活 かつ DNA转录
在 ざい 分子生物学 ぶんしせいぶつがく 中 なか ,转录因子 いんし (英語 えいご :Transcription factor )是 ぜ 指 ゆび 能 のう 够结合 あい 在 ざい 某 ぼう 基 もと 因 いん 上 うえ 游 ゆう 特 とく 异核 かく 苷酸序列 じょれつ 上 じょう 的 てき 蛋白 たんぱく 质 ,这些蛋白 たんぱく 质能调控其基因 いん 的 てき 转录 [ 1] [ 2] ,具体 ぐたい 是 ぜ 通 どおり 过调控 ひかえ 核 かく 糖 とう 核酸 かくさん 聚合酶 (RNA聚合酶,或 ある 叫 さけべ RNA合成 ごうせい 酶)与 あずか DNA 模 も 板 ばん 股 また 的 てき 结合。
转录因子 いんし 的 てき 本 ほん 质是与 あずか DNA特 とく 异性结合的 てき 一 いち 系列 けいれつ 蛋白 たんぱく 质。一般有不同的功能区域,如DNA结合结构域 いき 与 あずか 效 こう 应结构域。转录因子 いんし 不 ふ 单与基 もと 因 いん 上 じょう 游 ゆう 的 てき 启动子 こ 区域 くいき 结合,也可以和其它转录因子 いんし 形成 けいせい 转录因子 いんし 复合体 がったい 来 らい 影 かげ 响基因 いん 的 てき 转录,可 か 以产生 せい 很复杂而精 せい 细的影 かげ 响。结合在 ざい DNA上 じょう 的 てき 启动子 こ 以及增强 ぞうきょう 子 こ 之 の 类控制 せい 转录的 てき 区域 くいき 上 じょう ,促进或 ある 者 もの 抑制 よくせい DNA上 じょう 的 てき 遗传信 しん 息 いき 向 こう RNA转录的 てき 过程。转录因子 いんし 的 てき 这一机能可以单独,或 ある 者 もの 通 どおり 过与其它蛋白 たんぱく 质形成 けいせい 复合体 がったい 来 らい 完成 かんせい 。人 ひと 类的基 もと 因 いん 组上已 やめ 经推定 すいてい 出 で 大 だい 约1800个基因 いん 控 ひかえ 制 せい 转录因子 いんし 的 てき 编码。
转录因子 いんし 具有 ぐゆう DNA序列 じょれつ 的 てき 识别、结合以及控 ひかえ 制 せい 基 もと 因 いん 表 ひょう 达的基本 きほん 机 つくえ 能 のう 。在 ざい 基 もと 因 いん 转录活性 かっせい 化 か 以及相反 あいはん 地 ち 去 さ 活性 かっせい 化 か ,以及细胞内 ない 很多反 はん 应中扮 ふん 演 えんじ 重要 じゅうよう 的 てき 角 かく 色 しょく 。除 じょ 此之外 がい 以下 いか 列 れつ 出 で 一些重要的机能以供参考。
在 ざい 真 ま 核 かく 生物 せいぶつ 中 ちゅう ,转录开始时基本 きほん 转录因子 いんし (GTF)是 ぜ 必要 ひつよう 的 てき 存在 そんざい 。实际上 じょう ,大 だい 多数 たすう 基本 きほん 转录因子 いんし 与 あずか DNA是 ぜ 不 ふ 结合的 てき ,而是由 よし 存在 そんざい 的 てき 部分 ぶぶん 大型 おおがた 转录开始前 ぜん 复合体 がったい 与 あずか RNA聚合酶发生 せい 直接 ちょくせつ 性 せい 相互 そうご 作用 さよう 。通用 つうよう 的 てき 一般性基本转录因子有TFIIA、TFIIB、TFIID、TFIIE、TFIIF、TFIIH等 とう 等 とう 。
大 だい 多数 たすう 的 てき 转录因子 いんし 参与 さんよ 多 た 细胞生物 せいぶつ 的 てき 发育。这些转录因子 いんし 响应刺激 しげき ,控 ひかえ 制 せい 目 め 标基因 いん 的 てき 转录开始与 あずか 停止 ていし 。就这样,适当改 あらため 变了细胞的形 まとがた 态和活性 かっせい ,可 か 以构建 けん 推进细胞分化 ぶんか 和 かず 功 いさお 能 のう 决定的 てき 必要 ひつよう 状 じょう 态。比 ひ 如说,属 ぞく 于Hox族 ぞく 的 てき 转录因子 いんし 在 ざい 从果蝇到人 じん 类的适当身体 しんたい 构造的 てき 构建中 ちゅう 。另一个例子 こ 是 ぜ Y染色 せんしょく 体 たい 上 じょう 存在 そんざい 的 てき Sex-determining Region Y(SRY)编码的 てき 遗传因子 いんし ,在 ざい 哺乳 ほにゅう 动物的 てき 性 せい 别决定 てい 中表 なかおもて 现出重要 じゅうよう 的 てき 作用 さよう 。
胞间信号 しんごう 传递是 ぜ 指 ゆび 一些细胞中的分子被释放,其他细胞中 ちゅう 发生通 どおり 过信号 ごう 传递执行的 てき 连锁反 はん 应(级联)。基 もと 因 いん 的 てき 活 かつ 化 か /去 さ 活 かつ 化 か 所 しょ 必要 ひつよう 的 てき 信号 しんごう 途 と 径 みち 常 つね 是 ぜ 存在 そんざい 于级联下游 ゆう 转录因子 いんし 。雌 めす 激 げき 素 もと 受体转录因子 いんし 参与 さんよ 的 てき 雌 めす 激 げき 素 もと 信号 しんごう (传递)是 ぜ 一个具有相当短的级联反应的例子:卵巢 らんそう 和 わ 胎盘分泌 ぶんぴつ 的 てき 雌 めす 激 げき 素 もと 通 どおり 过细胞膜与 あずか 胞质内 ない 存在 そんざい 的 てき 雌 めす 激 げき 素 もと 受体相 しょう 结合;受体向 こう 细胞核 かく 内 ない 移 うつり 动并与特定 とくてい 的 てき DNA序列 じょれつ 结合,调节相 しょう 关的基 もと 因 いん 转录。
转录因子 いんし 活 かつ 动的情 じょう 况不仅仅是 ぜ 应对类似于信号 ごう 传导一 いち 类的生物 せいぶつ 学 がく 刺激 しげき ,也参与 さんよ 到 いた 对于环境刺激 しげき 的 てき 应对。为了在 ざい 高温 こうおん 条件下 じょうけんか 生存 せいぞん 所 しょ 必需 ひつじゅ 的 てき 激 げき 活 かつ 基 もと 因 いん 的 てき 热休克 かつ 因子 いんし (HSF),应对低 てい 氧条件下 じょうけんか 的 てき 低 てい 氧诱导因子 いんし (HIF),以及细胞内 ない 维持适当脂 あぶら 质水平 すいへい 的 てき 固 かた 醇 あつし 调节元 もと 件 けん 结合蛋白 たんぱく (Sterol Regulatory Element Binding Protein; SREBP)都 みやこ 是 ただし 例 れい 子 こ 。
大 だい 多数 たすう 转录因子 いんし 与 あずか 细胞周期 しゅうき 的 てき 调节相 しょう 关。无论细胞增 ぞう 长多大 だい ,(细胞)分裂 ぶんれつ 中 ちゅう 的 てき 任 にん 何 なん 时序(周期 しゅうき 区 く 间)都 みやこ 将 すすむ 被 ひ 其帮助 じょ 决定。转录因子 いんし 在 ざい 尤 ゆう 其细胞周期 き 调节中 ちゅう 的 てき 原 げん 癌 がん 基 もと 因 いん 和 わ 抑 そもそも 癌 がん 基 もと 因 いん 的 てき 诱导方面 ほうめん 起 おこり 到 いた 重要 じゅうよう 作用 さよう 。著名 ちょめい 的 てき 例 れい 子 こ 是 ぜ 在 ざい 细胞成 なり 长和凋亡中 ちゅう 发挥作用 さよう 的 てき Myc蛋白 たんぱく 。
转录因子 いんし 的 てき 调节是 ぜ 一个十分复杂的过程, 因 いん 为它取决于很多因 いん 素 もと ,其中最 さい 明 あかり 显的是 ぜ 其他的 てき DNA结合蛋白 たんぱく (包括 ほうかつ 转录因子 いんし 等 とう )以及局部 きょくぶ 的 てき 染色 せんしょく 体 たい 结构. 早期 そうき 的 てき 体外 たいがい 实验 认为DNA序列 じょれつ 决定转录因子 いんし 的 てき 装 そう 配 はい 顺序,但 ただし 愈 いよいよ 来 き 愈 いよいよ 多 おお 的 てき 证据显示转录的 てき 激 げき 活 かつ 取 と 决于大量 たいりょう 的 てき 转录因子 いんし 的 てき 相互 そうご 作用 さよう 。目前 もくぜん 表 おもて 观遗传学似 に 乎对转录激 げき 活 かつ 也扮演 えんじ 重要 じゅうよう 角 かく 色 しょく 。多 た 阶段调节、控 ひかえ 制 せい 机 つくえ 理 り 机 つくえ 制 せい 均 ひとし 由 よし 重要 じゅうよう 的 てき 生物 せいぶつ 学 がく 反 はん 应提供 ていきょう ,转录也不例外 れいがい 。转录水平 すいへい 的 てき 调节不 ふ 仅仅是 ぜ 由 よし 基 もと 因 いん 产物(RNA或 ある 蛋白 たんぱく 质)的 てき 量 りょう 来 らい 调节,也受到转录过程本身 ほんみ 的 てき 调节。以下 いか 是 ぜ 转录因子 いんし 活性 かっせい 调节系 けい 统简明 あかり 的 てき 清 きよし 单。
和 かず 其他的 てき 蛋白 たんぱく 质一样,转录因子 いんし 也是染色 せんしょく 体 たい 上 じょう 的 てき 基 もと 因 いん 转录成 なる RNA,并被翻 こぼし 译成蛋白 たんぱく 质。转录因子 いんし 产生和 わ 活性 かっせい 受到这些步 ふ 骤的影 かげ 响。一 いち 些转录因子 こ 可能 かのう 会 かい 显示出 で 对其自身 じしん 的 てき 产生具有 ぐゆう 抑制 よくせい 效 こう 应的特性 とくせい (负反馈)。转录因子 いんし 与 あずか 编码其自身 じしん 的 てき 基 もと 因 いん 相 しょう 结合的 てき 情 じょう 况下,通常 つうじょう 具有 ぐゆう 抑制 よくせい 方向 ほうこう 的 てき 作用 さよう 。这就是 ぜ 细胞内 ない 转录因子 いんし 水平 すいへい 维持在 ざい 较低区 く 间的机 つくえ 制 せい 之 の 一 いち 。
在 ざい 真 ま 核 かく 生物 せいぶつ 中 ちゅう ,转录因子 いんし 的 てき 转录在 ざい 核 かく 内 ない ,翻 こぼし 译在细胞质中进行。核 かく 内 ない 活 かつ 动的蛋白 たんぱく 质大多数 たすう 都 と 有 ゆう 将 はた 自身 じしん 引入核 かく 内 ない 的 てき 核 かく 定位 ていい 化 か 信号 しんごう 。然 しか 而,对于许多转录因子 いんし ,这(核 かく 定位 ていい 化 か 信号 しんごう )反 はん 而是核 かく 易 えき 位 い 过程调控的 てき 关键点 てん 。某 ぼう 些转录因子 こ (如核受体)为了迁移到 いた 细胞核 かく 中 ちゅう 必须在 ざい 细胞质中结合配 はい 位 い 体 たい 。
配 はい 体 たい 结合/通 つう 过化学 かがく 性 せい 修 おさむ 饰的活 かつ 化 か
配 はい 体 たい 的 てき 结合除 じょ 了 りょう 与 あずか 转录因子 いんし 的 てき 局部 きょくぶ 富 とみ 集 しゅう 相 しょう 关,也参与 さんよ 影 かげ 响着转录因子 いんし 的 てき 活性 かっせい 状 じょう 态(DNA与 あずか 其耦合 あい 因子 いんし 的 てき 结合与 あずか 否 いな )。除 じょ 了 りょう 通 どおり 过磷酸化 さんか 与 あずか DNA结合的 てき STAT蛋白 たんぱく ,通 つう 过化学 かがく 性 せい 修 おさむ 饰受到激 げき 活 かつ 的 てき 转录因子 いんし 也有 やゆう 很多。
在 ざい 真 ま 核 かく 的 てき 情 じょう 况下,转录活性 かっせい 低 ひく 的 てき 基 もと 因 いん 区 く 间内,组蛋白 しろ 或 ある 染色 せんしょく 质纤维呈现凝缩的异染色 しょく 质状态。异染色 しょく 质内部 ないぶ 的 てき DNA大 だい 多 た 不能 ふのう 与 あずか 转录因子 いんし 发生接触 せっしょく 。为了在 ざい 这种状 じょう 态下能 のう 够结合 あい DNA,首 しゅ 先 さき 有 ゆう 必要 ひつよう 把 わ 它的结构改 あらため 变成常 つね 染色 せんしょく 质,例 れい 如改变组蛋白 たんぱく 的 てき 结构。
有 ゆう 的 てき DNA片 へん 段 だん 已 やめ 经结合 あい 了 りょう 转录因子 いんし ,而对于结合 あい 对象为同一部位的其他转录因子而言,可 か 以视作 さく 是 ぜ 干 ひ 扰的因 いん 素 もと 。像 ぞう 这样,定 てい 向 こう 到 いた 同 どう 一基因上的多个转录因子,其中一个促进转录而其它种类起到抑制作用,有 ゆう 时就是 ぜ 展 てん 现这样一种互相拮抗的角色。
耦合因子 いんし 的 てき 作用 さよう /复合体 がったい 的 てき 形成 けいせい
大 だい 部分 ぶぶん 转录因子 いんし 没 ぼつ 有 ゆう 单独的 てき 功 こう 能 のう ,基 き 因 いん 的 てき 转录有 ゆう 必要 ひつよう 结合好 こう 几个转录因子 いんし 。这些转录因子 いんし 的 てき 复合体 がったい 就是填 はま 补前起 おこり 始 はじめ 复合物 ぶつ 或 ある RNA聚合酶使之 の 起 おこり 效 こう 的 てき 一种一种的耦合因子。这样,为了一种转录因子转录的开始,其他必要 ひつよう 的 てき 蛋白 たんぱく 质必须存在 そんざい ,且必须处于可以结合 あい 的 てき 状 じょう 态。
转录因子 いんし 存在 そんざい 高度 こうど 模 も 组化的 てき 构造。即 そく 各 かく 种参与 さんよ 转录调控的 てき 具有 ぐゆう 各自 かくじ 功 こう 能 のう 的 てき 区域 くいき (又 また 称 たたえ 为域)被 ひ 组合编入一个单一的转录因子。各 かく 功 こう 能 のう 区域 くいき 的 てき 排列 はいれつ 和 わ 数 すう 目 もく 取 と 决于转录因子 いんし 本身 ほんみ ,信号 しんごう 检知和 わ 激 げき 活 かつ 作用 さよう 在 ざい 很多情 たじょう 况下包含 ほうがん 在 ざい 同一 どういつ 区域 くいき 。
DNA结合域 いき (DNA binding domain; DBD)
同 どう DNA的 てき 特殊 とくしゅ 序列 じょれつ (如基因 いん 附近 ふきん 存在 そんざい 的 てき 启动子 こ 和 わ 增强 ぞうきょう 子 こ 序列 じょれつ )结合的 てき 区域 くいき 。与 あずか 转录调节直接 ちょくせつ 相 しょう 关,是 ぜ 最 さい 重要 じゅうよう 的 てき 领域(下面 かめん 详述)。与 あずか 转录因子 いんし 相 しょう 结合的 てき DNA序列 じょれつ 常常 つねづね 被 ひ 视为激 げき 素的 すてき 响应元 もと 件 けん 。
激 げき 活 かつ 结构域 いき (transactivation domain; TAD)
和 かず 其他的 てき 蛋白 たんぱく 质(例 れい 如耦合 あい 转录调节因子 いんし )结合的 てき 区域 くいき 。这一部分很多情况下被称呼为“激 げき 活 かつ 功 こう 能 のう 区 く ”。
信号 しんごう 检知域 いき signal sensing domain; SSD)或 ある 称 しょう 配 はい 体 たい 结合域 いき
通 どおり 过外部 ぶ 信号 しんごう 检出,传达信号 しんごう 到 いた 组成复合体 がったい 的 てき 剩余 じょうよ 部分 ぶぶん ,从而完成 かんせい 基 もと 因 いん 表 ひょう 达的控 ひかえ 制 せい 。SSD和 わ DBD在 ざい 转录因子 いんし 上 じょう 呈 てい 现离散分布 ぶんぷ ,形成 けいせい 的 てき 复合体 がったい 是 ぜ 他 た 们最初 はつ 互相整合 せいごう 功 こう 能 のう 的 てき 场合。
转录因子 いんし 由 ゆかり 多 た 个功能 のう 域 いき 构成,这种构造解析 かいせき 起 おこり 来 らい 并不简单。然 しか 而,实际上 じょう 和 わ DNA结合的 てき 部分 ぶぶん 也就是 ぜ 基 もと 于DNA结合域 いき 的 てき 解析 かいせき 和 わ 分 ぶん 类相对先进。以下 いか 所 しょ 示 しめせ 的 てき 是 ぜ 具有 ぐゆう 代表 だいひょう 性 せい 的 てき DNA结合领域分 ぶん 类。
同 どう 源 みなもと 结构域 いき (homeodomain)
与 あずか 果 はて 蝇的身体 しんたい 构造决定相 しょう 关的转录因子 いんし 被 ひ 检出的 てき 序列 じょれつ 和 わ 包括 ほうかつ 人 じん 在 ざい 内的 ないてき 高等 こうとう 动物相 しょう 比 ひ 高度 こうど 保守 ほしゅ 。具有 ぐゆう 螺旋 らせん -转角-螺旋 らせん (HTH)结构,拥有可 か 以辨识的第 だい 二 に 螺旋 らせん 。
例 れい 如类固 かた 醇 あつし 类激素 もと 受体的 てき 核 かく 内 ない 受体、GATA族 ぞく 中 ちゅう 的 てき 一个因子所观察到的构造,通 つう 过一个与锌配位的特定的立体构造与DNA结合。基 もと 于常见的氨基酸 さん 序列 じょれつ 、C2H2类型、C4来 らい 进行分 ぶん 类。
上 うえ 游 ゆう 碱性环-螺旋 らせん -环(basic-helix-loop-helix; bHLH)
HLH作 さく 为肌肉 にく 细胞分化 ぶんか 相 しょう 关和作 さく 为二噁英受体的转录因子被发现,这是一种转录因子两两结合的重要结构。转录因子 いんし 形成 けいせい 二 に 聚体,两个碱性结构域 いき 共同 きょうどう 识别DNA。
上 うえ 游 ゆう 碱性亮 あきら 氨酸拉 ひしげ 链(basic region-leucine zipper; bZip)
氨基酸 さん 序列 じょれつ 每 ごと 七个就被定位一个亮氨酸或者异亮氨酸并具有特征α あるふぁ 螺旋 らせん 构造,与 あずか 转录因子 いんし 形成 けいせい 二 に 聚体相 しょう 关。所 ところ 形成 けいせい 的 てき 二聚体的碱性功能域使得DNA可 か 以被识别。
已 やめ 知 ち 序列 じょれつ 的 てき 还有例 れい 如Winged helix(WH)、ETS等 とう 。
此外还存在 そんざい 着 ぎ 由 よし 于不具 ぐ 备DNA结合结构域 いき 而未分 ぶん 类的转录因子 いんし 未 み 被 ひ 分 ぶん 类,但 ただし 这些蛋白 たんぱく 质在转录调控中 ちゅう 存在 そんざい 着 ぎ 关键作用 さよう 。共 きょう 活 かつ 化 か 剂、染色 せんしょく 质再构成复合物 ぶつ (Chromatin Structure Remodeling; RSC)、组蛋白 しろ 乙 おつ 酰转移 うつり 酶、磷酸化 か 酶和甲 きのえ 基 はじめ 化 か 酶就属 ぞく 于这一 いち 类。
转录因子 いんし 所 しょ 结合的 てき 那 な 段 だん DNA序列 じょれつ 被 ひ 称 しょう 为转录因子 いんし 结合领域。转录因子 いんし 通 どおり 过氢键和范德华力组合装 そう 配 はい 后 きさき 与 あずか 这些区域 くいき 产生化学 かがく 性 せい 结合。由 よし 于这些化学 かがく 性 せい 相互 そうご 作用 さよう 的 てき 特性 とくせい ,使 つかい 得 とく 大 だい 多数 たすう 转录因子 いんし 都 と 能 のう 与 あずか 个别DNA序列 じょれつ 发生特 とく 异性结合。然 しか 而,转录因子 いんし 结合区域 くいき 的 てき 全部 ぜんぶ 碱基实际上 じょう 并不一定都与转录因子接触,结合力 ごうりょく 的 てき 大小 だいしょう 也因此而有 ゆう 所 しょ 不同 ふどう 。因 よし 此,转录因子 いんし 并非仅仅与单一DNA序列 じょれつ 相 しょう 结合,而可能 かのう 是 ぜ 拥有相似 そうじ 序列 じょれつ 的 てき 多 た 个区域 くいき 都 みやこ 能成 よしなり 为靶结合区 く 。
例 れい 如被称 しょう 为TATA结合蛋白 たんぱく 质(TBP)的 てき 转录因子 いんし 群 ぐん 有 ゆう 着 ぎ 共同 きょうどう 的 てき 结合区域 くいき 「TATAAAA」,TBP对于存在 そんざい 类似的 てき 序列 じょれつ 比 ひ 如「TATATAT」「TATATAA」都 と 可能 かのう 使 し 与 あずか 之 これ 耦合。
转录因子 いんし 能 のう 够与这样类似的 てき 序列 じょれつ 结合,此外还有和 わ 相 しょう 对较短 たん 的 てき 序列 じょれつ 结合的 てき 倾向。因 よし 此,由 ゆかり 于DNA序列 じょれつ 足 あし 够长,也难怪 かい 会 かい 偶然 ぐうぜん 出 で 现一些可以结合的区域。然 しか 而实际上,转录因子 いんし 并不结合到 いた 全部 ぜんぶ 拥有兼 けん 容 よう 性 せい 的 てき 序列 じょれつ 上 じょう 。比 ひ 如与DNA的 てき 亲和性 せい 以及耦合因子 いんし 的 てき 使用 しよう 可能 かのう 性 せい ,其他的 てき 制 せい 约缩小 しょう 了 りょう 转录因子 いんし 实际的 てき 结合范围。综上,有 ゆう 的 てき DNA序列 じょれつ 即 そく 使 し 被 ひ 全部 ぜんぶ 解析 かいせき ,我 わが 们也无法简单预测那 な 里 さと 实际上 じょう 是 ぜ 否 いや 有 ゆう 转录因子 いんし 结合的 てき 位 い 点 てん 。
机 つくえ 制 せい 分 ぶん 类
转录因子 いんし 在 ざい 机 つくえ 制 せい 的 てき 基 もと 础上,可 か 以分成 なり 三 さん 种。
与 あずか 转录开始的 てき 开始前 ぜん 复合体 がったい 的 てき 形成 けいせい 相 しょう 关。与 あずか 每 まい 个细胞中都 と 存在 そんざい 的 てき II类基因 いん 周 しゅう 围的核心 かくしん 启动子 こ 区域 くいき 相互 そうご 作用 さよう 。
与 あずか 转录起 おこり 始点 してん 上 じょう 游 ゆう 结合,促进或 ある 抑制 よくせい 转录方向 ほうこう 的 てき 转录因子 いんし 。又 また 称 たたえ 为转录调节因子 こ 。
与 あずか 上 うえ 游 ゆう 转录因子 いんし 相似 そうじ ,进行必要 ひつよう 的 てき 激 げき 活 かつ /抑制 よくせい 的 てき 功 こう 能 のう 表 ひょう 达
功 こう 能 のう 分 ぶん 类
除 じょ 了 りょう 按照机 つくえ 制 せい 进行分 ぶん 类外还可以按照 あきら 功 こう 能 のう 来 らい 分 ぶん 类。
组成性 せい 激 げき 活 かつ 型 がた ——全部 ぜんぶ 细胞一般情况下都存在的类型。例 れい 如基本 きほん 转录因子 いんし 、Sp1、NF1、CCAAT和 わ 增强 ぞうきょう 子 こ 结合蛋白 たんぱく 。
有 ゆう 条件 じょうけん 激 げき 活 かつ 型 がた ——需要 じゅよう 激 げき 活 かつ 的 てき 类型。
2.A 发育型 がた (细胞特 とく 异性) -表 ひょう 达被严格调控,一旦表达则不需要进一步的激活,例 れい 如GATA转录因子 いんし 、肝 かん 细胞核 かく 因子 いんし (HNF)、PIT-1、MyoD、Myf5、Hox、Winged Helix。
2.B 信号 しんごう 依 よ 赖型——需要 じゅよう 外部 がいぶ 信号 しんごう 激 げき 活 かつ 。
2.B.1 细胞外信 がいしん 号 ごう 依 よ 赖型——例 れい 如核内 ない 受体。
2.B.2 细胞内 ない 信号 しんごう 依 よ 赖型——细胞中 ちゅう 由 ゆかり 低 てい 水平 すいへい 物 ぶつ 质激活 かつ 。例 れい 如SREBP、p53、Orphan核 かく 内 ない 受体。
2.B.3 细胞膜 まく 受体依 よ 赖型——接受 せつじゅ 第 だい 二信使信号级联或通过磷酸化激活的类型。
2.B.3.a 原核 げんかく 因子 いんし (居 きょ 民 みん 核 かく 因子 いんし )——不 ふ 论是否 ひ 激 げき 活 かつ 均 ひとし 在 ざい 核 かく 内 ない 存在 そんざい 。例 れい 如CREB、AP-1、Mef2。
2.B.3.b 潜伏 せんぷく 细胞质因子 いんし ——非 ひ 激 げき 活 かつ 状 じょう 态存在 そんざい 于细胞质内 ない ,受到激 げき 活 かつ 后 きさき 被 ひ 定位 ていい 在 ざい 细胞核 かく 内 ない 的 てき 转录因子 いんし 。例 れい 如STAT、R-SMAD、NF-κ かっぱ B、Notch、TUBBY、NFAT。
DNA结合区域 くいき 的 てき 分 ぶん 类
最 さい 细化的 てき 转录因子 いんし 分 ぶん 类方式 しき ,通 つう 过其主要 しゅよう 的 てき 与 あずか DNA结合区域 くいき 来 らい 划分。这里以Superclass・Class・Family三个等级来进行表记,某 ぼう 些情况下提供 ていきょう Subfamily作 さく 为更加 か 细化的 てき 分 ぶん 类。
基 もと 础域
碱性亮 あきら 氨酸拉 ひしげ 链
AP-1类似组件(例 れい 如c-Fos、c-Jun)
CREB
CCAAT增强 ぞうきょう 子 こ 结合蛋白 たんぱく (C/EBP)类似因子 いんし
bZIP/PAR
植物 しょくぶつ G-box结合因子 いんし
单纯ZIP
上 うえ 游 ゆう 碱性基 もと 团的螺旋 らせん -环-螺旋 らせん 结构
普 ひろし 适因子 こ (class A)
生 なま 肌 はだ 转录因子 いんし (MyoD)
Achaete-Scute
Tal/Twist/Atonal/Hen
螺旋 らせん -环-螺旋 らせん -亮 あきら 氨酸拉 ひしげ 链(bHLH-ZIP)
普 ひろし 适bHLH-ZIP因子 いんし (例 れい 如USF、SREBP)
细胞周期 しゅうき 调节因子 いんし (例 れい 如c-Myc)
NF-1
NF-1(NFIC)
RF-X
RF-X(NFX)
bHSH
锌配位 い DNA結合 けつごう 域 いき
Cys4(核 かく 内 ない 受体型 がた )
类固醇 あつし 激 げき 素 もと 受体
甲状腺 こうじょうせん 激 げき 素 もと 受体类似因子 いんし
diverse Cys4 zinc fingers
GATA因子 いんし
Cys2His2锌指域 いき
普 ひろし 适因子 こ (例 れい 如TFIIIA、Sp1)
有 ゆう NF-6B类似结合能力 のうりょく 的 てき 大型 おおがた 因子 いんし
Cys6 cysteine-zinc cluster
交互 こうご 配置 はいち 型 がた 锌指
螺旋 らせん -转角-螺旋 らせん
同 どう 源 みなもと box
单纯同 どう 源 みなもと box(Ubx)
POU因子 いんし (例 れい 如Oct)
具有 ぐゆう LIM区域 くいき 的 てき 同 どう 源 みなもと 域 いき
具有 ぐゆう 锌指的 てき 同 どう 源 みなもと 域 いき
Paired box
具有 ぐゆう 同 どう 源 みなもと 域 いき 的 てき Paired box
单纯Paired box
Fork head/Winged helix
発生 はっせい 調節 ちょうせつ 因子 いんし (例 れい 如forkhead)
组织特 とく 异性调节因子 いんし
细胞周期 しゅうき 调节因子 いんし
其他调节因子 いんし
热休克 かつ 因子 いんし (HSF)
HSF
色 いろ 氨酸集 しゅう 群 ぐん
Myb
Ets类
干 ひ 扰素调节因子 いんし
TEA域 いき
TEA
β べーた -Scaffold因子 いんし (伴 ばん 有 ゆう Minor Groove Contact)
RHR(Rel homology region)
Rel/ankyrin、NF-kB
ankyrinのみ
NF-AT
STAT
STAT
p53
p53
MADS-box
分化 ぶんか 调节因子 いんし (例 れい 如Mef2)
細胞 さいぼう 外 がい シグナル応答 おうとう 因子 いんし (SRF)
β べーた -Barrel α あるふぁ -helix
TATA结合蛋白 たんぱく (TBP)
TBP
SOX、SRY
TCF-1
HMG2关联因子 いんし 、SSRP1
MATA
Heteromeric CCAAT factor
Heteromeric CCAAT factors
Grainyhead
Grainyhead
冷 ひや 休 きゅう 克 かつ 域 いき
csd
Runt
Runt
其他转录因子 いんし
铜拳头蛋白 しろ
HMGI(Y)
HMGI(Y)
口 くち 袋 ぶくろ 域 いき
E1A类似因子 いんし
AP-2/EREBP关联因子 いんし
(2.2) 其他的 てき Cys4 结构
(2.3) Cys2 His2
(2.4) Cys6
(2.5)交替 こうたい composition
(3.2)配 はい 对框
(3.6)TEA结构域 いき
transcriptional enhancer factor (
1 、
2 、
3 、
4 )
(4) 具有 ぐゆう 小 しょう 凹槽触 さわ 点 てん 的 てき β べーた -支 ささえ 架 か 因子 いんし
(4.3) p53样转录因子 いんし
(4.11) Runt
(0) 其他转录因子 いんし
(0.2) HMGI(Y)
(0.6) Miscellaneous
信號 しんごう 傳送 でんそう 途 と 徑 みち 調 しらべ 控 ひかえ 因子 いんし
按距離 きょり 其它概念 がいねん
基 もと 础概念 がいねん 基 もと 因 いん 架 か 构非 ひ 遗传因 いん 素的 すてき 影 かげ 响发育架 か 构 遗传系 けい 统的进化 对发育 そだて 的 てき 控 ひかえ 制 せい
有 ゆう 影 かげ 响力的 てき 人物 じんぶつ 争 そう 议