SARSコロナウイルス2-ゼータ株かぶ

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SARSコロナウイルス2-ゼータ株かぶ（サーズコロナウイルスツーゼータかぶ、英語えいご: SARS-CoV-2 Zeta variant、別名べつめい: 系統けいとう P.2、系統けいとう B.1.1.28.2、20B/S.484K）は、新型しんがたコロナウイルス感染かんせん症しょう (COVID-19) の原因げんいんウイルスとして知しられるSARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) の変異へんい株かぶである。ブラジルのリオデジャネイロ州しゅうで最初さいしょに検出けんしゅつされた。

世界せかい保健ほけん機関きかん (WHO) は注目ちゅうもくすべき変異へんい株かぶ (VOI) に指定していし、WHOラベルではゼータ株かぶ (Zeta variant) に分類ぶんるいしていた^[1]が、2021年ねん7月がつにVOIから除外じょがいされた^[1]^[2]^[3]。

E484K 変異へんいは含ふくまれているが、N501Y及およびK417T変異へんいは含ふくまれていない。また、マナウスのガンマ株かぶ（系統けいとう P.1）に直接ちょくせつ関係かんけいすることはなく、リオデジャネイロで独立どくりつして進化しんかしたと考かんがえられる^[4]^[5]。

分類ぶんるい[編集へんしゅう]

命名めいめい[編集へんしゅう]

2020年ねん4月がつ、この系統けいとうがブラジルのリオデジャネイロ州しゅうで初はじめて記録きろくされ、後のちに系統けいとう P.2 (lineage P.2) と命名めいめいされた^[1]^[6]。2021年ねん5月がつ末まつ、WHOは懸念けねんされる変異へんい株かぶ (VOC) や注目ちゅうもくすべき変異へんい株かぶ (VOI) にギリシャ文字もじを使用しようする新あたらしい方針ほうしんを導入どうにゅうした後のち、系統けいとう P.2に対たいしゼータ (ζぜーた:Zeta) のラベルを割わり当あてた^[1]^[6]。

変異へんい[編集へんしゅう]

「SARSコロナウイルス2の変異へんい株かぶ#ミスセンス変異へんい」も参照さんしょう

ゼータ株かぶのゲノムには、E484K・D614G・V1176Fの3つのアミノ酸あみのさん変異へんいがあり、これらはすべてウイルスのスパイクタンパク質たんぱくしつコードに含ふくまれている^[7]。アメリカ疾病しっぺい予防よぼう管理かんりセンター (CDC) によると、F565Lはすべてではないが、一部いちぶのゼータ変異へんい株かぶ配列はいれつで検出けんしゅつされている^[8]。

スパイクタンパク質たんぱくしつに焦点しょうてんを当あてたSARS-CoV-2のゲノムマップ上じょうにプロットされたゼータ株かぶのアミノ酸あみのさん変異へんい^[7]。

脚注きゃくちゅう[編集へんしゅう]

[脚注きゃくちゅうの使つかい方かた]

^ ^a ^b ^c ^d “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語えいご). who.int. World Health Organization. 2021年ねん10月がつ1日にち閲覧えつらん。
^ 感染かんせん・伝播でんぱ性せいの増加ぞうかや抗原こうげん性せいの変化へんかが懸念けねんされる新型しんがたコロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規しんき変異へんい株かぶについて（第だい11報ほう） - 国立こくりつ感染かんせん症しょう研究所けんきゅうじょ (2021年ねん7⽉17⽇) 、2021年ねん8月がつ15日にち閲覧えつらん。
^ “当とうセンターにおける新型しんがたコロナウイルス変異へんい株かぶのスクリーニング検査けんさ結果けっかについて（2021年ねん10月がつ12日にち更新こうしん）”. 東京とうきょう都と健康けんこう安全あんぜん研究けんきゅうセンター. 2021年ねん10月がつ13日にち時点じてんのオリジナルよりアーカイブ。2021年ねん10月がつ13日にち閲覧えつらん。
^ “PANGO lineages Lineage P.2”. COV lineages. 2021年ねん1月がつ28日にち閲覧えつらん。 “P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage”
^ Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana et al. (2021-04-26). “Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil”. Journal of Virology 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194.
^ ^a ^b “新型しんがたコロナウイルス感染かんせん症しょうの世界せかいの状況じょうきょう報告ほうこく”. 厚生こうせい労働ろうどう省しょう. (2021年ねん6月がつ8日にち) 2021年ねん10月がつ2日にち閲覧えつらん。
^ ^a ^b “Spike Variants: Zeta variant, aka P.2”. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database (2021年ねん7月がつ1日にち). 2021年ねん7月がつ5日にち閲覧えつらん。
^ “SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions”. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 2021年ねん7月がつ5日にち閲覧えつらん。

外部がいぶリンク[編集へんしゅう]

Tracking SARS-CoV-2 variants（英語えいご） - 世界せかい保健ほけん機関きかん (WHO)
Variants of the Virus（英語えいご） - アメリカ疾病しっぺい予防よぼう管理かんりセンター (CDC)
Lineage P.2（英語えいご） - Cov-Lineages
Zeta Variant Report（英語えいご） - outbreak.info
新型しんがたコロナウイルス感染かんせん症しょうについて - 厚生こうせい労働省ろうどうしょう
- 新型しんがたコロナウイルス感染かんせん症しょうに関かんする報道ほうどう発表はっぴょう資料しりょう変異へんい株かぶ - 厚生こうせい労働省ろうどうしょう
新型しんがたコロナウイルス感染かんせん症しょう（COVID-19）関連かんれん情報じょうほう - 国立こくりつ感染かんせん症しょう研究所けんきゅうじょ

[WHO-1] “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語えいご). who.int. World Health Organization. 2021年ねん10月がつ1日にち閲覧えつらん。

[2] 感染かんせん・伝播でんぱ性せいの増加ぞうかや抗原こうげん性せいの変化へんかが懸念けねんされる新型しんがたコロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規しんき変異へんい株かぶについて（第だい11報ほう） - 国立こくりつ感染かんせん症しょう研究所けんきゅうじょ (2021年ねん7⽉17⽇) 、2021年ねん8月がつ15日にち閲覧えつらん。

[tokyo-eiken-lb_virus-mutation-3] “当とうセンターにおける新型しんがたコロナウイルス変異へんい株かぶのスクリーニング検査けんさ結果けっかについて（2021年ねん10月がつ12日にち更新こうしん）”. 東京とうきょう都と健康けんこう安全あんぜん研究けんきゅうセンター. 2021年ねん10月がつ13日にち時点じてんのオリジナルよりアーカイブ。2021年ねん10月がつ13日にち閲覧えつらん。

[4] “PANGO lineages Lineage P.2”. COV lineages. 2021年ねん1月がつ28日にち閲覧えつらん。 “P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage”

[5] Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana et al. (2021-04-26). “Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil”. Journal of Virology 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194.

[forth210611-6] “新型しんがたコロナウイルス感染かんせん症しょうの世界せかいの状況じょうきょう報告ほうこく”. 厚生こうせい労働ろうどう省しょう. (2021年ねん6月がつ8日にち) 2021年ねん10月がつ2日にち閲覧えつらん。

[Stanford1-7] “Spike Variants: Zeta variant, aka P.2”. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database (2021年ねん7月がつ1日にち). 2021年ねん7月がつ5日にち閲覧えつらん。

[CDC_variants-8] “SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions”. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 2021年ねん7月がつ5日にち閲覧えつらん。

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

分類ぶんるい[編集へんしゅう]

命名めいめい[編集へんしゅう]

変異へんい[編集へんしゅう]

脚注きゃくちゅう[編集へんしゅう]

関連かんれん項目こうもく[編集へんしゅう]

外部がいぶリンク[編集へんしゅう]