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启动

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ざい遗传がくなか启动promoterゆびいちだんのう使特定とくていもといん进行转录てきDNA序列じょれつ。启动以被RNA聚合酶べん认,并开はじめ转录合成ごうせいRNAざいRNA合成ごうせいちゅう,启动以和调控もといん转录てき转录因子いんし产生相互そうご作用さようひかえせいもといんひょう转录てきおこりはじめ时间ひょう达的程度ていど包含ほうがん核心かくしん启动区域くいき调控区域くいき,就像“开关”,决定もといんてきかつ动,继而ひかえせい细胞开始せい产哪いち蛋白たんぱく

启动于控せいもといんひょう达的调控序列じょれつなかもといん转录おこりはじめてんてきじょうゆうあさこうDNAせい义链てき5′方向ほうこう),长约100~1000个碱基对。启动本身ほんみ并无编译こうのうただし它拥ゆう对基いんこぼし译氨もとさんてきゆび挥作よう,就像いちめんはた帜,其核こころ部分ぶぶん编码うえゆうてきRNA聚合酶结合てんゆび挥聚あい酶的合成ごうせい,这种酶指导RNAてき复制合成ごうせいよし此该段位だんいてき启动发生突变(变异),はた对基いんてきひょう达有毁灭せい作用さよう

完全かんぜんてき启动しょう规范序列じょれつ

启动もとけん (promoter element)

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启动代表だいひょう一些重要的元件可以与其他调节区域(如增强ぞうきょう沉默、边界もとけんある绝缘合作がっさく一致いっち,以主导もといん转录てき水平すいへいよし于启动子一般都是在基因的上游,启动所在しょざいてき位置いちある转录おこり始点してんかいゆかり+1开始编号。うえゆうてき位置いち所以ゆえんゆかり+1逆数ぎゃくすうてき负数,れい如-100就是位置いち100てきうえゆう碱基对以下いかかく种启动子:

  • 核心かくしん启动引发转录てき必要ひつよう部分ぶぶん及转录起始点してん位置いち约为-35。且是RNA聚合酶てき结合てん及一般转录因子结合位点。
  • きんはし启动もといんてききんはし序列じょれつじょうゆう包括ほうかつ一些基本的调控元件,位置いち约为-250,且是特定とくてい转录因子いんし结合てん
  • 远处启动もといんてき远处序列じょれつじょうゆう包括ほうかつ一些额外的调控元件,かげ响力较近はし启动じゃく。它是ざいうえゆうさら远的位置いちただし位置いちせいてき增强ぞうきょうある调控区域くいき),特定とくてい转录因子いんし结合てん

启动规范序列じょれつてき用途ようと一般都是有问题的,且可引致いんち对启动子序列じょれつてき误解。ざい规范序列じょれつちゅう,转录因子いんし结合点在てんざい特定とくてい细胞じょう况下ゆう一个单独的序列会与蛋白たんぱく牢固ろうこ结合。ただし自然しぜん选择かい偏向へんこう低能ていのう量的りょうてき结合,さく为一种调节转录输出。这种さい普遍ふへんてき序列じょれつしょう野生やせいがた序列じょれつ。这纵しかさい有利ゆうりてき序列じょれつ最近さいきん证据显示种基いん包括ほうかつはらがんもといんみやこゆうG四股しこ结构さく潜在せんざい调控信号しんごう

ざいえんじ生物せいぶつがくてき一个主要问题是修补启动子序列在演化过程中的重要性,れいひと统从くろ猩猩しょうじょうぶん开后てきあらため变。ぼう些演生物せいぶつがくけん议启动子てきえんじある调节区域くいき可能かのう序列じょれつ编码さら重要じゅうよう

启动序列じょれつ

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原核げんかく生物せいぶつ启动

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ざい原核げんかく生物せいぶつなか,启动包含ほうがん两个たん序列じょれつ于从转录おこり结点おこり计的-10及-35じょうゆう位置いち于-10てき序列じょれつしょうひろしさとぬの诺框ある-10げんけん,及通常つうじょう包含ほうがん6个かくTATAAT。ひろしさとぬの诺框ざい开始转录绝对必要ひつようてき。其他于-35てき序列じょれつ通常つうじょう包含ほうがん6个核苷TTGACA。它的现可以帮すけ非常ひじょうだかてき转录りつ。一些启动子含有所谓的“延伸えんしん-10げんけん”(どうみなもと序列じょれつ5'-TGNTATAAT-3'),从这些元けん开始,-35げんけんざい转录时显とく重要じゅうよう上述じょうじゅつてき启动结构ただゆう以原かく生物せいぶつRNA聚合酶てきσしぐま-70形式けいしきらいべん认。原核げんかく生物せいぶつRNA聚合酶复ごうぶつ连同其他σしぐま因子いんし以辨认不同ふどうてき核心かくしん启动序列じょれつ。 启动一段位于结构基因5‘はしてきうえゆうてきDNA序列じょれつのうげきかつRNA聚合酶,使つかいあずかばんDNAじゅん确地结合并具有ぐゆう转录おこりはじめてきとく异性。

以下いかかく苷出现的がいりつ

序列じょれつ かく
-10序列じょれつ T A T A A T
77% 76% 60% 61% 56% 82%
-35序列じょれつ T T G A C A
69% 79% 61% 56% 54% 54%

かく生物せいぶつ启动

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かく生物せいぶつ启动极端てき分化ぶんか及很难表现其とくせい。它们一般いっぱん处于もといんてきじょうゆう及有远离转录おこり始点してんてき调控もとけん。转录复合ぶつ以引おこりだつ氧核とう核酸かくさん(DNA)こう自己じこ屈曲くっきょく,以容许放置ほうち调控序列じょれつ。很多かく生物せいぶつ启动ただし全部ぜんぶ包含ほうがんいちTATA盒序列じょれつTATAAA)かいあずかTATA结合蛋白たんぱく结合,以协じょ形成けいせいRNA聚合酶转录复合ぶつ[1]TATA盒一般会处于非常接近转录起始点(通常つうじょう于50个碱基对以内いない)。

かく生物せいぶつ启动调控序列じょれついち般与转录因子いんし结合,とうなかわたる形成けいせい转录复合ぶついち个例E盒(序列じょれつCACGTG),它会あずか碱性螺旋らせん-环-螺旋らせん(bHLH)てき转录因子いんし结合。[2]

结合

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启动序列じょれつ(P)あずかσしぐま因子いんしRNA聚合酶复合ぶつ(R)てき结合わたる及两个步骤:

あずか启动こうのう变异ゆう关的疾病しっぺい

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以下いかひと类孟とく尔遗传学(OMIM)证实与启动故障こしょうゆう关,论是いん启动序列じょれつ直接ちょくせつ突变ある转录因子いんしある转录どもげき因子いんしてき突变。而多种がんしょうぼつゆうれついん为从染色せんしょくたいえき产生はまごうもといん

よう留意りゅういてきざい病原びょうげんがく上大かみおお部分ぶぶんてき疾病しっぺい异质てき,而在分子ぶんし层面じょう一种疾病往往是指多种疾病,纵然它们てきびょうせい及治疗方ほう一致いっち疾病しっぺい对治疗有不同ふどうてきはん应,いんきさき分子ぶんしげん头的异,这会药物遗传がくてき范畴。

参考さんこう文献ぶんけん

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  1. ^ Smale ST, Kadonaga JT. The RNA polymerase II core promoter (PDF). Annu Rev Biochem. 2003, 72: 449–479 [2006-11-17]. PMID 12651739. (原始げんし内容ないよう (PDF)そん档于2006-10-31). 
  2. ^ Levine M, Tjian R. Transcription regulation and animal diversity (PDF). Nature. 2003, 424 (6945): 147–151 [2006-11-17]. PMID 12853946. (原始げんし内容ないよう (PDF)そん档于2007-01-22). 
  3. ^ Hobbs, K.; Negri, J.; Klinnert, M.; Rosenwasser, L.J.; and Borish, L. Interleukin-10 and transforming growth factor-beta promoter polymorphisms in allergies and asthma. Am J Respir Crit Care Med. 1998, 158 (6): 1958–1962. PMID 9847292. 
  4. ^ Burchard, E.G.; Silverman, E.K.; Rosenwasser, L.J.; Borish, L.; Yandava, C.; Pillari, A.; Weiss, S.T.; Hasday, J.; Lilly, C.M.; Ford, J.G.; and Drazen, J.M. Association between a sequence variant in the IL-4 gene promoter and FEV(1) in asthma. Am J Respir Crit Care Med. 1999, 160 (3): 919–922 id = PMID 10471619. 
  5. ^ Kulozik, A.E.; Bellan-Koch, A.; Bail, S.; Kohne, E.; and Kleihauer, E. Thalassemia intermedia: moderate reduction of beta globin gene transcriptional activity by a novel mutation of the proximal CACCC promoter element. Blood. 1991, 77 (9): 2054–2058 id = PMID 2018842. 
  6. ^ Petrij F, Giles RH, Dauwerse HG, Saris JJ, Hennekam RC, Masuno M, Tommerup N, van Ommen GJ, Goodman RH, Peters DJ; et al. Rubinstein-Taybi syndrome caused by mutations in the transcriptional co-activator CBP. Nature. 1995, 376 (6538): 348–351. PMID 7630403.