生物 の分類
概説
しかしながら、それぞれの
現代 的 な系統 分類 について
ドメイン
[
エオサイト説
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従来 の分類 との関係
2 |
3 |
5 |
6 |
3ドメイン |
||
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リンネ (1735 |
ヘッケル (1866 |
ホイッタカー (1969 |
ウーズ (1977 |
ウーズ (1990 |
レイクら (1984 | |
モネラ |
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アーキア ( |
アーキア
ただし |
メタン | ||||
キノコ、カビ | ||||||
コケ | ||||||
真 核 生物 の大 分類 群
真 核 生物 - アモルフェア Amorphea
- ディアフォレティケス Diaphoretickes
- ディスコバ Discoba
- メタモナダ Metamonada
- クルムス CRuMs
- (その
他 )
分類 階級
ドメイン: | domain: | regio: | |||||
kingdom: | regnum: | なし | プロテオ | ||||
phylum /division: |
phylum /divisio: |
( |
担子 |
プロテオバクテリア |
クレン | ||
class: | classis: | テルモプロテウス | |||||
order: | ordo: | サル |
シソ |
ハラタケ |
エンテロバクター |
デスルフロコックス | |
family: | familia: | ヒト |
シソ |
キシメジ |
デスルフロコックス | ||
genus: | genus: | ヒト Homo |
ローズマリー Rosemarinus |
エノキタケ Flammulina |
エスケリキア Escherichia |
アエロピュルム Aeropyrum | |
species: | species: | H. sapiens | R. officinalis | F. velutipes | E. coli | A. pernix |
門 は、動物 学 と細菌 学 ではphylum、植物 学 、菌類 学 ではdivision/divisioと使 い分 ける。中間 的 分類 が必要 なときの階級 名 は、その分類 単位 よりも上位 の分類 には、巨 (magn-)・上 (super-)・大 (grand-) を、下位 の分類 には、亜 (sub-)・下 (infra-)・小 (Parv-) などの接頭 語 を各 階級 の頭 につけて生成 させる。- subfamily(
亜 科 )とgenus(属 )の間 をさらに細分 する必要 があるときは、tribe(動物 では族 、植物 では連 )を使 う。 - subgenus(
亜 属 )とspecies(種 )の間 をさらに細分 する必要 があるときは、section(節 )を使 う。
階級 別 の学名 の接尾 辞
rank |
||||||
(ICN[ |
(ICN[ |
(ICN[ |
(ICZN[15]) |
(ICNP[16][17]) | ||
Division/Phylum | -phyta | -ota | ||||
Subdivision/Subphylum | -phytina | |||||
Class | -opsida | -phyceae | -ia | -ia | ||
Subclass | -idae[ |
-phycidae | -idae | |||
Order | -ales | -ales | ||||
Suborder | -ineae | -ineae | ||||
Superfamily | -oidea | |||||
Family | -aceae | -idae | -aceae | |||
Subfamily | -oideae | -inae | -oideae | |||
Tribe | -eae | -ini | -eae | |||
Subtribe | -inae | -ina | -inae |
一般 的 分類 例
原核 生物
細菌 (ドメイン:バクテリア)
- アキドバクテリウム
門 - アクイフェックス
門 - アクチノバクテリア
門 - エルシミクロビウム
門 - カルディセリクム
門 - クラミジア
門 - クロロビウム
門 - クロロフレクサス
門 - クリシオゲネス
門 - サーモデスルフォバクテリア
門 - シアノバクテリア
門 - ゲマティモナス
門 - シネルギステス
門 - スピロヘータ
門 - ディクチオグロムス
門 - デイノコッカス-サーマス
門 - テネリクテス
門 - デフェリバクター
門 - テルモトガ
門 - ニトロスピラ
門 - バクテロイデス
門 - フィルミクテス
門 - フィブロバクター
門 - フソバクテリウム
門 - プランクトミケス
門 - プロテオバクテリア
門 - ウェルコミクロビウム
門 - レンティスファエラ
門
古 細菌 (ドメイン:アーキア)
真 核 生物
原生 生物 界
植物 界
菌 界
- ツボカビ
門 (ツボカビ) 接合 菌 門 (ケカビ、クモノスカビ)子 嚢菌門 (酵母 、アカパンカビ)- 担子
菌 門 (キノコ) 不完全 菌 (アオカビなど。現在 は分類 群 としては認 めない)地衣 植物 門 (菌類 と藻類 の共生 体 ・学名 は菌類 のもの)
動物界
海綿動物 門 平板 動物 門 (センモウヒラムシ)刺 胞動物 門 (クラゲ、イソギンチャク、サンゴ)有 櫛 動物 門 (クシクラゲ)中 生 動物 門 (ニハイチュウ)扁 形 動物 門 (ウズムシ、プラナリア)紐 形 動物 門 (ヒモムシ)顎 口 動物 門 腹 毛 動物 門 輪形 動物 門 (ワムシ)動 吻動物 門 鉤 頭 動物 門 内 肛動物 門 線形 動物 門 (回虫 、C. elegans)類 線形 動物 門 (ハリガネムシ)外 肛動物 門 箒 虫 動物 門 腕 足 動物 門 軟体動物 門 (貝 、イカ、タコ)鰓 曳動物 門 星 口 動物 門 (ホシムシ)- ユムシ
動物 門 環 形 動物 門 (ミミズ、ゴカイ)緩 歩 動物 門 (クマムシ)五 口 動物 門 有 爪 動物 門 (カギムシ)節足動物 門 棘皮動物 門 (ウニ、ヒトデ、クモヒトデ、ナマコ、ウミユリ)毛 顎 動物 門 (ヤムシ)半 索 動物 門 (ギボシムシ)脊索 動物 門
分子 系統 学 的 分類 例
20
細菌 (Bacteria) エステル型 脂質 を持 つ原核 生物 、ムレイン細胞 壁 - テルモトガ
門 (Thermotogae) - アクウィフェクス
門 (Aquificae) - テッラバクテリア (Terrabacteria) グラム
陽性 関連 細菌 及 び藍色 細菌 藍色 細菌 (Cyanobacteria)酸素 発生 型 光合成 細菌 - クロロフレクサス
門 (Chloroflexi) - デイノコックス・テルムス
門 (Deinococcus-Thermus) - フィルミクテス
門 (Firmicutes) グラム陽性 低 GC含量。芽胞 形成 放線 菌 (Actinobacteria) グラム陽性 高 GC含量。菌糸 及 び胞子 形成
- グラム
陰性 菌 コア(ヒュドロバクテリア、グラキリクテス)- FCB
群 - PVC
群 - クラミジア
門 (Chlamydiae) - ウェルコミクロビウム
門 (Verrucomicrobia) - プランクトミケス
門 (Planctomycetes) - レンティスファエラ
門 (Lentisphaerae)
- クラミジア
- プロテオバクテリア (Proteobacteria)
- スピロヘータ
門 (Spirochetes)
- FCB
- CPR
群 巨大 な未 培養 系統
- テルモトガ
古 細菌 (Archaea) (他 生物 に対 して対 掌 体 の)エーテル型 脂質 を持 つ原核 生物 。真 核 生物 (Eukaryote)核 膜 有 り、線 状 染色 体 、細胞 骨格 ・原 形質 流動 有 り、80Sリボソーム、有 糸 分裂 有 り- バイコンタ (Bikonta) 2
本 鞭 毛 を持 つ真 核 生物 (退化 により持 たないものも有 り)植物 (狭義 、一 次 植物 )(Plantae, Archaeplastida)一 次 共生 により葉 緑 体 を獲得 した真 核 生物 の直系 の子孫 、板 状 ミトコンドリアクリステ、葉 緑 体 包 膜 が2重 盤 状 クリステ類 (Discicristatae)盤 状 ミトコンドリアクリステ、エクスカヴェートに含 める意見 有 り- エクスカヴェート (Excavates)
細胞 腹 側 に深 くえぐれた捕食 装置 を有 する真 核 生物 の一群 - マラウイモナス (Malawimonas)
盤 状 クリステ類 の可能 性 あり - トリコゾア
類 (Trichozoa):ディプロモナス類 、レトルタモナス類 、パラバサリア類 - アネロモナス
類 (Anaeromonada):オキシモナス類
- マラウイモナス (Malawimonas)
- ストラメノパイル (Stramenopiles)
中空 の鞭 毛 小 毛 を有 する真 核 生物 の一群 、アルベオラータを含 めてクロマルヴェオラータ (Chromalveolata) とする意見 有 り - アルベオラータ (Alveolata)
細胞 膜 直下 に扁平 な小 胞を有 する真 核 生物 の一群 - リザリア (Rhizaria)
分子 情報 による類縁 、アメーバ状 生物 が多 いが全 てに共通 する形態 的 特性 は無 い 所属 不明
- ユニコンタ (Unikonta) 1
本 鞭 毛 を持 つ真 核 生物 (真 菌類 は退化 して鞭 毛 を持 たない)
- バイコンタ (Bikonta) 2
歴史
アリストテレスの分類
どのような
有 血 動物 無血 動物 不完全 卵生 - 軟体
類 - 軟殻
類
- 軟体
蛆 生 あるいは自然 発生 有 節 類
無性 生殖 または自然 発生 殻 は類 - その
他
アリストテレスの
リンネの分類
リンネは
しかしリンネの
また、リンネの
五 界 説
ドメインの提唱
1937
1990
脚注
注釈
出典
- ^ a b #
矢島 (2020) p.72. - ^ Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Caceres, Eva F.; Saw, Jimmy H.; Bäckström, Disa; Juzokaite, Lina; Vancaester, Emmelien; Seitz, Kiley W.; Anantharaman, Karthik et al. (2017-01). “Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity” (
英語 ). Nature 541 (7637): 353–358. doi:10.1038/nature21031. ISSN 0028-0836 . - ^ Spang, Anja; Saw, Jimmy H.; Jørgensen, Steffen L.; Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Martijn, Joran; Lind, Anders E.; van Eijk, Roel; Schleper, Christa et al. (2015-05). “Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes” (
英語 ). Nature 521 (7551): 173–179. doi:10.1038/nature14447. ISSN 0028-0836. PMC 4444528. PMID 25945739 . - ^ Liu, Yang; Makarova, Kira S.; Huang, Wen-Cong; Wolf, Yuri I.; Nikolskaya, Anastasia N.; Zhang, Xinxu; Cai, Mingwei; Zhang, Cui-Jing et al. (2021-05-27). “Expanded diversity of Asgard archaea and their relationships with eukaryotes” (
英語 ). Nature 593 (7860): 553–557. doi:10.1038/s41586-021-03494-3. ISSN 0028-0836 . - ^
Woese C, Kandler O, Wheelis M (1990). “Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.(
生物 の自然 機構 について:古 細菌 、細菌 、真 核 生物 の3ドメインの提案 )”. Proc Natl Acad Sci U S A 87 (12): 4576-9. PMID 2112744. - ^ ここに
載 せた具体 例 は下記 より引用 :藤田 敏彦 (2010/4/28).動物 の系統 分類 と進化 .新 ・生命 科学 シリーズ.裳 華 房 . ISBN 978-4785358426 p91 - ^ “
中学校 理科 教科書 「未来 へ広 がるサイエンス」”.啓 林 館 . 2018年 7月 11日 閲覧 。 - ^ Adl, Sina M.; Bass, David; Lane, Christopher E.; Lukeš, Julius; Schoch, Conrad L.; Smirnov, Alexey; Agatha, Sabine; Berney, Cedric et al. (2018-09-26). “Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes” (
英語 ). Journal of Eukaryotic Microbiology: jeu.12691. doi:10.1111/jeu.12691. ISSN 1066-5234. PMC 6492006. PMID 30257078 . - ^ a b ICN 2018, Article 16.3.
- ^ ICN 2018, Article 17.1.
- ^ ICN 2018, Article 18.1.
- ^ ICN 2018, Article 19.1.
- ^ ICN 2018, Article 19.3.
- ^ ICN
日本語 版 2019,命名 法 用語 集 . - ^ ICZN 2000, Article 29.2.
- ^ ICNP 2019, Rule 8.
- ^ ICNP 2019, Rule 9.
- ^
原核 生物 のphylumの名前 が変 わりました、独立 行政 法人 製品 評価 技術 基盤 機構
参考 文献
命名 規約
- Turland, N. J., Wiersema, J. H., Barrie, F. R., Greuter, W., Hawksworth, D. L., Herendeen, P. S., Knapp, S., Kusber, W.-H., Li, D.-Z., Marhold, K., May, T. W., McNeill, J., Monro, A. M., Prado, J., Price, M. J. & Smith, G. F., ed (2018). International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Shenzhen Code) adopted by the Nineteenth International Botanical Congress Shenzhen, China, July 2017. Regnum Vegetabile 159. Glashütten: Koeltz Botanical Books. doi:10.12705/Code.2018. ISBN 978-3-946583-16-5
- オンライン
版 : Turland, N.J.; et al.: “International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Shenzhen Code) adopted by the Nineteenth International Botanical Congress Shenzhen, China, July 2017 (electronic ed.)”. International Association for Plant Taxonomy (2018年 ). 2021年 7月 2日 閲覧 。 日本語 版 :日本 植物 分類 学会 ・国際 命名 規約 邦訳 委員 会 編 , ed (2019-09-10).国際 藻類 ・菌類 ・植物 命名 規約 (深 圳規約 ).北 隆 館
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- the International Commission on Zoological Nomenclature (ICZN) (1999). International Code on Zoological Nomenclature (4 ed.). The International Trust for Zoological Nomenclature. ISBN 0-85301-006-4 In: Ride, W.D.L.;H.G. Cogger; C. Dupuis; O. Kraus; A. Minelli; F. C. Thompson; P.K. Tubbs, ed (1999). International Code of Zoological Nomenclature Fourth Editon adopted by the International Union of Biological Sciences. London: International Trust for Zoological Nomenclature. pp. xxix+306 pp
- オンライン
版 :“The Code Online (INTERNATIONAL CODE OF ZOOLOGICAL NOMENCLATURE Fourth Edition)”. International Commission on Zoological Nomenclature. 2021年 7月 2日 閲覧 。 日本語 版 :動物 命名 法 国際 審議 会 著 、野田 泰一 ・西川 輝昭 編 『国際 動物 命名 規約 第 4版 日本語 版 』日本 動物 分類 学 関連 学会 連合 、札幌 、2000年 、xviii + 133 pp頁 。日本語 版 追 補 :動物 命名 法 国際 審議 会 著 、野田 泰一 ・西川 輝昭 編 『国際 動物 命名 規約 第 4版 日本語 版 [追 補 ]』日本 分類 学会 連合 、東京 、2005年 10月 。ISBN 4-9980895-1-X 。
- オンライン
- “International Code of Nomenclature of Prokaryotes [Prokaryotic Code (2008 Revision)]”. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY 69 (1A). (2019-01-11). doi:10.1099/ijsem.0.000778.